32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2236 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  100 
 
 		 226 aa  473  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  67.41 
 
 		 225 aa  334  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  66.96 
 
 		 225 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  52.25 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  41.23 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  50.44 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  48.28 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  45.52 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  47.01 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  38.52 
 
 		 174 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  29.21 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  44.9 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  44.9 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  48 
 
 		 699 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 702 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  41.05 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  43.69 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  44.21 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  37.04 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  45.26 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  45.26 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  40.2 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  37.62 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  43.16 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  34.65 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  31.65 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  35.44 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>