63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1529 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  50.59 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  48.82 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  50.44 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  51.91 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  50 
 
 
348 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  50 
 
 
348 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  51.46 
 
 
351 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  39.08 
 
 
367 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  35.4 
 
 
373 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  33.82 
 
 
369 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  34.4 
 
 
367 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  34.4 
 
 
367 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  34.4 
 
 
367 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  34.4 
 
 
367 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  33.82 
 
 
367 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  36.16 
 
 
375 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  34 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  34.29 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  36.8 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  33.05 
 
 
362 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 
745 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  34.69 
 
 
369 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  34.98 
 
 
356 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  32.85 
 
 
360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  31.04 
 
 
377 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  32.46 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  35.18 
 
 
366 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  30.67 
 
 
745 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  33.91 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.74 
 
 
612 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  31.82 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  36.36 
 
 
323 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.15 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  33.57 
 
 
336 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.4 
 
 
1225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  32.02 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  28.69 
 
 
400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  31.19 
 
 
370 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  26.67 
 
 
395 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  26.8 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  21.96 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  21.41 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  26.13 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  27.11 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  27.87 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  22.9 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  33.54 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  28.2 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  32.28 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  22.74 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  23.79 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1726  hypothetical protein  25.82 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.045903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  22.8 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  23.26 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  23.08 
 
 
431 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  25.95 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.35 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  22.61 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  24.26 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0764  hypothetical protein  23.14 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2436  hypothetical protein  22.49 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2682  hypothetical protein  24.55 
 
 
352 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>