More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1255 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 		 387 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  50.39 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  51.14 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  45.95 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  47.14 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  41.9 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  41.09 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  39.8 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  38.5 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  35.29 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  35.29 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  33.77 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  35.49 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  34.55 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  34.55 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.37 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  29.88 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.74 
 
 		 401 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.38 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.78 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  33.45 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.74 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.5 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.65 
 
 		 414 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  30.1 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.61 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  30 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.06 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.25 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.63 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.15 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.49 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.53 
 
 		 662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.96 
 
 		 608 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.96 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.84 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.05 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.51 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.91 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.44 
 
 		 610 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  28.27 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.44 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.89 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  28.5 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  26.6 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.23 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.94 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.19 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.05 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.11 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.35 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.24 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.05 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.3 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.52 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.89 
 
 		 630 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28.34 
 
 		 682 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.4 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  25.42 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  29.84 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.16 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.91 
 
 		 678 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  30.04 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.11 
 
 		 644 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  29.41 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  29.41 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.47 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.57 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.46 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  32.77 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.85 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  29.07 
 
 		 688 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  29.89 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.55 
 
 		 418 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  28 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.24 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.96 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  28.12 
 
 		 604 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  28.12 
 
 		 604 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.28 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.15 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.07 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.97 
 
 		 418 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  32.47 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  26.69 
 
 		 666 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.12 
 
 		 650 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  28.41 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  28.82 
 
 		 660 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>