29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1203 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  48.51 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  43.85 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  42.96 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  45.04 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.76 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  37.78 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  42.96 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  34.56 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  40.7 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  35.94 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  34.02 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  53.66 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  25.22 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  32.99 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>