More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2102 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  88.43 
 
 		 415 aa  734    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 415 aa  838    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  78.38 
 
 		 408 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 412 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 		 402 aa  494  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 407 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 407 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 418 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3541  tyrosyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  42.31 
 
 		 438 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 413 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 402 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 400 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02940  tyrosyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 399 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0125  tyrosyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000022394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0514  tyrosyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 404 aa  294  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 403 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0142  tyrosyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000366869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 413 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>