146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3867 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  36.56 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  39.51 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  33.33 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.31 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.9 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.14 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.14 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  42.19 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.26 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  31.46 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.87 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40.68 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40.68 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.68 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  31.46 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  29.76 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  29.55 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  28.92 
 
 
94 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
100 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.67 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  26.97 
 
 
107 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.89 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.72 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  37.14 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.81 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  30.56 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.53 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.47 
 
 
108 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
96 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
97 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  29.41 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
101 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.6 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.69 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.18 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.91 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  26.97 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>