More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0125 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 374 aa  767    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.65 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.21 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.2 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.69 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.4 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.34 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.58 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  27.99 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.32 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.73 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  25.22 
 
 		 379 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.16 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.57 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.53 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  24.42 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.65 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.04 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  27.17 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  26.01 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  27.09 
 
 		 406 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  26.38 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  26.48 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  25.96 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  27.78 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  26.73 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  27.22 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  27.93 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  27.93 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  27.78 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  30.09 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.88 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.78 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.98 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  26.57 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  28.17 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.33 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.07 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  25.41 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.07 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.77 
 
 		 408 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.44 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  27.33 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  29.37 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  26.52 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.8 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  25.73 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  25.45 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.91 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  26.54 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  26.86 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  26.65 
 
 		 427 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.22 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.58 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  25.97 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.38 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  25.98 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  24.57 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  24.05 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  28.27 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.18 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.74 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09230  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  25.38 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.08 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  22.89 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  23.8 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  22.89 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>