30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1899 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  100 
 
 		 404 aa  845    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 		 627 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  26.76 
 
 		 600 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  26.42 
 
 		 640 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  23 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  22.67 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.62 
 
 		 635 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  28.33 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  24.12 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  26.01 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  26.18 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  24.1 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  24.79 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  26.18 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  27.97 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3584  hypothetical protein  20.98 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.121359  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.31 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  24.03 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  25.53 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  24.59 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  24.3 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.09 
 
 		 625 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  22.83 
 
 		 604 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  23.57 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  22.54 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  20.24 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  25.32 
 
 		 669 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  25.32 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25.22 
 
 		 597 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>