16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2011 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  818    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  66.92 
 
 
406 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  65.9 
 
 
410 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  65.66 
 
 
425 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  45.97 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  42 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  43.06 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  37.38 
 
 
429 aa  280  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  45.51 
 
 
419 aa  280  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  25 
 
 
404 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  24.09 
 
 
600 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  20.73 
 
 
627 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.79 
 
 
635 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  23.65 
 
 
640 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  30.11 
 
 
421 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  27.96 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>