15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0195 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  887    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  49.02 
 
 
415 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  42.23 
 
 
447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  43.44 
 
 
443 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  39.7 
 
 
406 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  37.38 
 
 
405 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  38.42 
 
 
410 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  40 
 
 
419 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  39.01 
 
 
425 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  24.1 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.44 
 
 
635 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  28.77 
 
 
640 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  24.85 
 
 
600 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 
627 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  23 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>