15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1185 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  814    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  88.54 
 
 		 425 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  70.3 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  65.9 
 
 		 405 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  44.39 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  41.52 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  41.41 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  41.73 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  38.42 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  24.12 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  20.88 
 
 		 627 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  21.79 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.44 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  22.65 
 
 		 640 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  24.3 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>