22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0771 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  73.68 
 
 		 421 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  855    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3584  hypothetical protein  32.24 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.121359  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  22.67 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  19.91 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  23.17 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.91 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  30.51 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  36.89 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  20.68 
 
 		 640 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  28.9 
 
 		 664 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  28.81 
 
 		 660 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  28.1 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  28.32 
 
 		 664 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  28.32 
 
 		 664 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  26.13 
 
 		 649 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  28.32 
 
 		 663 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  28.9 
 
 		 663 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  27.75 
 
 		 661 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  25.63 
 
 		 649 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  30.06 
 
 		 670 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>