17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0035 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  73.68 
 
 		 422 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  852    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3584  hypothetical protein  32.63 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.121359  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  23 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  21.13 
 
 		 627 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.71 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  35.29 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  28.41 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  26.51 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  19.75 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  30.52 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  24.3 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  30.11 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  25.42 
 
 		 660 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  30.39 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  23 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  22.49 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>