30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6857 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 383 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  54.97 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.34 
 
 		 763 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  32.21 
 
 		 667 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  30.3 
 
 		 669 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  31 
 
 		 677 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  30.29 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.97 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  27.03 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  25.54 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  26.14 
 
 		 1050 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  27.01 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  28.53 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  30.83 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  27.78 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  25.93 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  23.8 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  34.72 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  33.81 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  22.61 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  27.24 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  24.76 
 
 		 591 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  25.53 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5390  hypothetical protein  22.62 
 
 		 557 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.585501  normal  0.23439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  23.33 
 
 		 749 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  22.03 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.56 
 
 		 673 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  28.71 
 
 		 835 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  23.79 
 
 		 568 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>