33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6731 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 394 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  56.62 
 
 		 383 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  38.73 
 
 		 763 aa  236  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  32.23 
 
 		 669 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  32.49 
 
 		 667 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  33.51 
 
 		 677 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.63 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  29.79 
 
 		 440 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  27.15 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  27.63 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  29.65 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  25.11 
 
 		 1050 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  27.75 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  30.19 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  29.26 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  24.78 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  38.28 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  22.13 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  32.04 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  26.32 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  24.31 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  31.4 
 
 		 600 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  26.22 
 
 		 749 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  24.87 
 
 		 591 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  25.45 
 
 		 850 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  30.21 
 
 		 844 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  23.56 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5390  hypothetical protein  27.11 
 
 		 557 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.585501  normal  0.23439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  32.29 
 
 		 835 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0285  glycoside hydrolase family 42 protein  24.64 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696362  hitchhiker  0.00613688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>