More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5326 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5326  aminotransferase, class V  100 
 
 		 387 aa  767    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.121125 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0304  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  37.77 
 
 		 405 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  43.42 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  37.99 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  38.16 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.04 
 
 		 402 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  37.77 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  38.16 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  35.88 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  37.67 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  37.3 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  36.68 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  37.67 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  36.8 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  36.6 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  36.6 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  36.6 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  36 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  36.97 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  36.51 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  36 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.27 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  37.8 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  37.7 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  36.7 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.25 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  36.87 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  36.44 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  40.11 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  36.46 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  36.71 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  36.7 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  36.36 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  35.75 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  35.28 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  36.44 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  38.27 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  36.73 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  37.87 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  36.73 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  35.9 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.46 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  37 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  34.1 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  38.61 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  36.48 
 
 		 407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  36.07 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  35.9 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  36.46 
 
 		 407 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  37.89 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  37.2 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  38.34 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  35.36 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  38.34 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  35.64 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  34.82 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  36.36 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  38.5 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.82 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  36.14 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  34.83 
 
 		 404 aa  222  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>