75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4386 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  51.61 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  46.89 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  42.05 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  38.76 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.52 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  38.61 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 		 164 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 		 164 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 		 164 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.89 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.53 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.32 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.38 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.93 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  28.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.17 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.56 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.13 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  25.19 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  25.17 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.49 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  27.71 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.85 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.68 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.98 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  25.2 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  23.65 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.56 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.64 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  23.29 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  24.39 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  24.36 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  22.45 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.61 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  22.36 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  25.17 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  23.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.3 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 		 283 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.56 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.45 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  24.44 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  24.22 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  23.53 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.2 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.09 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  25.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  24.67 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.45 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  27.11 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.29 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  26.21 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  23.58 
 
 		 145 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.39 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.1 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.1 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  21.77 
 
 		 163 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.1 
 
 		 197 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  20.55 
 
 		 153 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  24.18 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.18 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>