53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3301 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  829    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  51.45 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  42.24 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  43.27 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  42.47 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  42.47 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  42.47 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  41.38 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  41.29 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  40.89 
 
 		 419 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  42.82 
 
 		 385 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  34.11 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  30.53 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  34.29 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.95 
 
 		 434 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  35.23 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  31.65 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.31 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  32.43 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  30.33 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  29.74 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  32.36 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.9 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  30.97 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.9 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  28.17 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  33.07 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  30.93 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.38 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  29.84 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  30.46 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  31.91 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  31.91 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  31.91 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  31.23 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  30.97 
 
 		 374 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  32.63 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  29.95 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.87 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  35.27 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  29.67 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  29.67 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  30.77 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  30.59 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  29.16 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  28.99 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  27.6 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  28.91 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  30.91 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  27.89 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  29.49 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  26.27 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>