28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2574 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1011    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  55.07 
 
 		 525 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  46.28 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  40.86 
 
 		 935 aa  300  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 930 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  35.84 
 
 		 967 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  32.02 
 
 		 946 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 944 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  36.95 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  38.18 
 
 		 473 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  30.82 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.35 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  28.52 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  38.2 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  36.23 
 
 		 433 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  36.7 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  37.04 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  31.03 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  36.49 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  29.9 
 
 		 554 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 		 564 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.52 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.98 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  35.04 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.71 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  36.7 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  31.65 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  29.81 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>