248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1913 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  100 
 
 
356 aa  693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  35.41 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  34.52 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  36.26 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  32.88 
 
 
371 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.06 
 
 
392 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  32.64 
 
 
404 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  29.8 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  25.85 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  28.92 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  31.22 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  33.52 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  30.28 
 
 
433 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  30.48 
 
 
436 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  30.89 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  30.89 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  30.89 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  37.97 
 
 
391 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  29.95 
 
 
404 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  27.44 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  33.33 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  38.6 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  44.83 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  28.82 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  35.22 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.76 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  37.34 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.99 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  28.34 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  30.58 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  29.47 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  29.01 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  29.66 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  31.75 
 
 
404 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  34.27 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.81 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  32.81 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  31.52 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  26.78 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  30.96 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  28.12 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  26.51 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  28.4 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  30.03 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  26.8 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  30.65 
 
 
389 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  26.09 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.95 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  29.3 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  30.56 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  26.39 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.26 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  25.93 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  26.9 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  25.39 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  25.98 
 
 
380 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  25.79 
 
 
715 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.9 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  28.21 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  27.95 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  25.47 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  32.19 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  30.15 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  26.32 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.94 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  26.61 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  27.65 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  35.94 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  27.65 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  22.4 
 
 
584 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.53 
 
 
681 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  26.76 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  28.5 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0593  acyltransferase 3  31 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  27.79 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  26.1 
 
 
391 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  32.53 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  25.38 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  28.16 
 
 
454 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  31.65 
 
 
1062 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  31.36 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  27.65 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  24.86 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  29.94 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  26.6 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.99 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  27.71 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  30.5 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  26.7 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.11 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  31.82 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  27.93 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  27.93 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  30.5 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  27.98 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.53 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  28.23 
 
 
515 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  27.33 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  23.18 
 
 
660 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  27.33 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>