More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0622 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
294 aa  594  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.59 
 
 
291 aa  357  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.2 
 
 
290 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.86 
 
 
292 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.86 
 
 
292 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.82 
 
 
291 aa  348  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.15 
 
 
296 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.5 
 
 
293 aa  344  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.34 
 
 
295 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.05 
 
 
296 aa  342  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.33 
 
 
291 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
291 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.18 
 
 
292 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.14 
 
 
291 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.16 
 
 
292 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.63 
 
 
291 aa  332  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.81 
 
 
296 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.8 
 
 
296 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.5 
 
 
292 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.52 
 
 
289 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.52 
 
 
289 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.31 
 
 
291 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.84 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.19 
 
 
299 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  56.8 
 
 
294 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.8 
 
 
294 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.18 
 
 
290 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.46 
 
 
294 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.82 
 
 
290 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.88 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.18 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.14 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.25 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.27 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.27 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.73 
 
 
296 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.08 
 
 
293 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  52.54 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  50.68 
 
 
292 aa  255  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.12 
 
 
287 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
288 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.24 
 
 
287 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 
287 aa  228  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.07 
 
 
290 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
289 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  42.52 
 
 
297 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
290 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
290 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.09 
 
 
288 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.3 
 
 
287 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.59 
 
 
294 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.93 
 
 
289 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 
287 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
291 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.42 
 
 
290 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  41.95 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.11 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.37 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  43.75 
 
 
294 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
282 aa  208  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  38.68 
 
 
345 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.27 
 
 
298 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 
298 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
283 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.19 
 
 
295 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  40.26 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.29 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  40.97 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  40.07 
 
 
286 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40.2 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.33 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.48 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  40.6 
 
 
299 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.39 
 
 
293 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41 
 
 
295 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 
291 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.86 
 
 
291 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 
293 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 
293 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.87 
 
 
289 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.84 
 
 
291 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.06 
 
 
287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.3 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.71 
 
 
290 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.56 
 
 
293 aa  185  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.87 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  36.27 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
294 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
291 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
291 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.59 
 
 
291 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>