152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 119 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  52.21 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  51.3 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  49.12 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  51.85 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  50 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  47.79 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  49.56 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  47.79 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  48.28 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  49.56 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  49.12 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  51.33 
 
 		 133 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  51.33 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  51.33 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.79 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  46.9 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  46.9 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  56.38 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  47.79 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  44.25 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  40.18 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.96 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  35.65 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 372 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.65 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 689 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  48.39 
 
 		 549 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  34.86 
 
 		 509 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 312 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 385 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  30.63 
 
 		 283 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 377 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 361 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 388 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 361 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 		 667 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 411 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 261 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 439 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 445 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 286 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 556 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 357 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 366 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 		 562 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 359 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 538 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  28.18 
 
 		 694 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 549 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 288 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 421 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 314 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 559 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 		 428 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.71 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 568 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.09 
 
 		 284 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  34.33 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 521 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 361 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 638 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  34.33 
 
 		 286 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 430 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 280 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 359 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 281 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>