More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.04 
 
 		 259 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.03 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.89 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  64.86 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.74 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 		 268 aa  315  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.62 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.23 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.23 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  58.82 
 
 		 257 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.04 
 
 		 261 aa  293  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.04 
 
 		 257 aa  287  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.92 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.98 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.92 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.72 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.13 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.06 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.13 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  51.23 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  51.23 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.23 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.65 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.2 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  45.24 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 277 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.12 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.89 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4270  enoyl-CoA hydratase  53.19 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>