More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  100 
 
 
208 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  68.28 
 
 
199 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  60.75 
 
 
223 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  61.45 
 
 
192 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  60.43 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  61.41 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  62.01 
 
 
195 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  57.22 
 
 
208 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  55.5 
 
 
204 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  58.99 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  57.3 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  53.98 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  55.37 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  51.34 
 
 
192 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  55.98 
 
 
194 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  54.01 
 
 
201 aa  191  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  50.28 
 
 
198 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50.28 
 
 
199 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  57.87 
 
 
199 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  51.1 
 
 
185 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  51.45 
 
 
186 aa  184  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  54.02 
 
 
183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  56.07 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  44.75 
 
 
184 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.2 
 
 
184 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  58.89 
 
 
203 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  48.88 
 
 
194 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  50.77 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  51.12 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  50.79 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  51.09 
 
 
198 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  57.87 
 
 
188 aa  177  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  51.09 
 
 
198 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  51.09 
 
 
198 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  50.27 
 
 
197 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  44.94 
 
 
184 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.07 
 
 
200 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  51.37 
 
 
190 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.18 
 
 
210 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.18 
 
 
210 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.18 
 
 
210 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  54.49 
 
 
218 aa  174  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  54.29 
 
 
193 aa  174  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  44.67 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  45.51 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  44.94 
 
 
186 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  46.67 
 
 
184 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  41.34 
 
 
184 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  53.71 
 
 
180 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  47.19 
 
 
188 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.3 
 
 
194 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  48.62 
 
 
217 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  43.15 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  51.45 
 
 
183 aa  168  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  56.36 
 
 
173 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  45.45 
 
 
185 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  39.67 
 
 
216 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  39.67 
 
 
216 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  46.59 
 
 
199 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.9 
 
 
224 aa  167  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.36 
 
 
207 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  48.02 
 
 
209 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.36 
 
 
207 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  49.17 
 
 
197 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  56.67 
 
 
194 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.36 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  50.81 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  42.94 
 
 
204 aa  165  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.36 
 
 
207 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  48.69 
 
 
203 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  42.13 
 
 
210 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  46.02 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  49.15 
 
 
186 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  43.18 
 
 
204 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  49.16 
 
 
191 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  47.73 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  44.69 
 
 
205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  46.51 
 
 
206 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  48.89 
 
 
190 aa  161  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  52.54 
 
 
216 aa  160  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  48.63 
 
 
205 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  43.17 
 
 
207 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  46.77 
 
 
204 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  46.07 
 
 
207 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.37 
 
 
203 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  43.26 
 
 
208 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  45.93 
 
 
206 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  44.38 
 
 
229 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  45.93 
 
 
206 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  43.26 
 
 
195 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.07 
 
 
207 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  45.16 
 
 
225 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  52.12 
 
 
202 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  51.18 
 
 
203 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  47.16 
 
 
209 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.37 
 
 
203 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  44.77 
 
 
206 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  45.51 
 
 
207 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  45.51 
 
 
207 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>