More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0450 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0450  Signal recognition particle protein  100 
 
 		 447 aa  897    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.768325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1650  signal recognition particle protein  64.92 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  63.41 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  63.18 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  63.41 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1434  signal recognition particle protein  60.82 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0675  signal recognition particle protein  60.14 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.511297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0997  signal recognition particle protein  61.59 
 
 		 445 aa  551  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  59.5 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  43.27 
 
 		 439 aa  358  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  41.86 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  45.54 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.86 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  43.25 
 
 		 492 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  43.69 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  44.34 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  43.59 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  41.78 
 
 		 440 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  41.56 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  43.13 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  42.92 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  42.92 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  42.92 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  42.92 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  42.92 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  43.36 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 449 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 449 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  42.47 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.6 
 
 		 481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  41.86 
 
 		 508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  41.3 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  39.55 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  41.88 
 
 		 453 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.93 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  40.74 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  42.54 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.87 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  42.54 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.65 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  41.67 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  41.63 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  40.96 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  42.12 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  40.4 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  41.94 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  39.25 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  41.99 
 
 		 458 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  43.37 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  41.37 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  40.05 
 
 		 516 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  42.36 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  41.51 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.16 
 
 		 505 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  42.16 
 
 		 505 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  39.74 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  40.59 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  39.31 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.31 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  40.59 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  41.54 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  41.39 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  41.26 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 518 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  42.39 
 
 		 448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  37.81 
 
 		 444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  41.47 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 515 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  38.06 
 
 		 442 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  40.05 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  40.94 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  40.37 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  39.29 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.68 
 
 		 512 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  40.59 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  39.01 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  38.38 
 
 		 451 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>