37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4559 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  92.42 
 
 		 499 aa  870    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  968    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  53.7 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  41.77 
 
 		 523 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  40.66 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  37.03 
 
 		 485 aa  280  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  43.68 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  41.37 
 
 		 519 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  40.81 
 
 		 498 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  41.26 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  36.57 
 
 		 648 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  39.71 
 
 		 496 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  39.09 
 
 		 530 aa  266  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  38.52 
 
 		 544 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  38.52 
 
 		 544 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  38.52 
 
 		 544 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  39.34 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  37.43 
 
 		 560 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  35.26 
 
 		 629 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  35.93 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  38.32 
 
 		 586 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  39.17 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  38.28 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  38.05 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  40.27 
 
 		 456 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  33.41 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  35.25 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  33.98 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  24.67 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  28.25 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.29 
 
 		 481 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.25 
 
 		 474 aa  67  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  31.28 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  28.93 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  34.09 
 
 		 396 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  28.69 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>