More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4476 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4476  histidine kinase A domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  906    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4989  histidine kinase  87.6 
 
 		 484 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784849  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00723596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  44.02 
 
 		 483 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0950  histidine kinase  50.14 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  38 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.56 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  35.83 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  36.48 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.13 
 
 		 467 aa  136  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.69 
 
 		 496 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.55 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.89 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2938  ATPase domain-containing protein  39.08 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.13 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.55 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.55 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.14 
 
 		 491 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.43 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.58 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 365 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.11 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  33.33 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.87 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.3 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.16 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  38.21 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.49 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.23 
 
 		 452 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.13 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  33.01 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  33.01 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2567  histidine kinase  38.85 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0076552  hitchhiker  0.00389148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.01 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  33.01 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  33.65 
 
 		 359 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.01 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.44 
 
 		 1162 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 466 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 490 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  34.63 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.67 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  34.89 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.17 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  32.79 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.13 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  33.77 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  37.1 
 
 		 594 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.06 
 
 		 503 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  23.82 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.63 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.8 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  36.15 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.8 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>