More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4137 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  83.07 
 
 		 190 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  83.07 
 
 		 190 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  83.07 
 
 		 190 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  75.14 
 
 		 184 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  48.96 
 
 		 219 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.95 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  49.47 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  44.79 
 
 		 191 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.6 
 
 		 188 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  49.73 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50.26 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  45.36 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.1 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  47.37 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.42 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.42 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.08 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.63 
 
 		 187 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  46.63 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  47.4 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.99 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  44.44 
 
 		 183 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  44.44 
 
 		 183 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  42.86 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  43.65 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  45.16 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  45.99 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.88 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  45.55 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  44.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  44.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44.39 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  43.81 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.94 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  44.27 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  44.27 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 		 185 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 185 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.92 
 
 		 182 aa  148  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  48.21 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  48.21 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.32 
 
 		 185 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  41.05 
 
 		 184 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  48.21 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  46.24 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.34 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  43.52 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  42.63 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.32 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  47.67 
 
 		 210 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  44.21 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  47.94 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  45.36 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  44.15 
 
 		 194 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  48.05 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  45.13 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  45.13 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  45.13 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  50.55 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  47.06 
 
 		 189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  49.02 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  49.02 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  45.13 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  41.09 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  41.09 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  48.67 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  39.27 
 
 		 196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  48.59 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  46.71 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.49 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 		 196 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 192 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  41.54 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42 
 
 		 197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 188 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  41.54 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.55 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  47.59 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>