43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0370 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  82.99 
 
 		 333 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  47.7 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  46.8 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  42.65 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  44.09 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  42.99 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  37.88 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  35.06 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  26.33 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  29.18 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  26.63 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  28.61 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  36.69 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  37.14 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.59 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  36.59 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.64 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  41.24 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  43.01 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  24.4 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.58 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  34.74 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  38.82 
 
 		 1048 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  33.72 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  31.21 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.81 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  30.3 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  26.56 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  26.87 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.98 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.93 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  23.63 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  50 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  23.68 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  25.16 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  34.41 
 
 		 220 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  24.87 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  34.41 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  30.17 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  29.76 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 364 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>