48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0233 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  908    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 480 aa  322  8e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  31.92 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  22.96 
 
 		 468 aa  93.6  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25.15 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  23.2 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  25.72 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  25 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  20.35 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  22.12 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  22.12 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  21.54 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  21.7 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  33.58 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  32.09 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  20.32 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  18.22 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  32.09 
 
 		 539 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  29.93 
 
 		 540 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  32.09 
 
 		 539 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>