202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3711 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  70.14 
 
 		 555 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1039    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  36.05 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  35.43 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  34.27 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  34.5 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 454 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  31.84 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  36.11 
 
 		 446 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  33.01 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  34.14 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  33.01 
 
 		 433 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  31.5 
 
 		 445 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  34.98 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  34.43 
 
 		 461 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  31.9 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  34.52 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  30.16 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  33.59 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 458 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
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NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  32.87 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  28.04 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  23.32 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.2 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.86 
 
 		 370 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  24.91 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.24 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  25.9 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.6 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.16 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  23.58 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  23.71 
 
 		 368 aa  90.9  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  21.64 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.16 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.77 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.63 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.46 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2339  Lysine 2,3-aminomutase  29.2 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000106877  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.26 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  29.24 
 
 		 414 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  28.34 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2661  L-lysine 2,3-aminomutase  28.19 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0706515  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3953  Lysine 2,3-aminomutase  29.19 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.8 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.83 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.75 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.32 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  29.41 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  28.57 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  29.78 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.91 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  27.43 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.41 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  26.52 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  26.52 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  25.1 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.28 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  25.74 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.61 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21810  L-lysine 2,3-aminomutase  25.51 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.359691  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  21.62 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  21.43 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  22.99 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.4 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.4 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.68 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  26.37 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  21.43 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3716  Lysine 2,3-aminomutase  25.73 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.38 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  22.51 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.39 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.53 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.12 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  25.19 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  22.26 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.71 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.62 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  26.52 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.4 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.41 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.41 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.88 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  27.17 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.4 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  27.62 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  27.62 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  28.02 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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