36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9182 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 628 aa  1161    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  48.97 
 
 		 568 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.63 
 
 		 592 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4512  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.15 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.06 
 
 		 543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.22 
 
 		 433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8359  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.13 
 
 		 1005 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2716  alanine-rich protein  32.72 
 
 		 344 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0574  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit sigma24 -like protein  36.48 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.423328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.72 
 
 		 2914 aa  79.7  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0393  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.72 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.041427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0148  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.44 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.44 
 
 		 2449 aa  73.9  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4964  hypothetical protein  44.55 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920058  normal  0.171463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2870  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  39.41 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3642  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.59 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.45 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.12 
 
 		 1888 aa  63.9  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  57.33 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  25.41 
 
 		 913 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  31.1 
 
 		 285 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.49 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.49 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.36 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  51.56 
 
 		 848 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28 
 
 		 654 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  50 
 
 		 623 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  38.14 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  42.31 
 
 		 497 aa  51.2  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0296  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.48 
 
 		 512 aa  50.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166156  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1218 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8182  hypothetical protein  32.75 
 
 		 662 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3991  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.07 
 
 		 186 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75873  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7240  putative RNA polymerase sigma factor  32.93 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00570923  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  59.57 
 
 		 1123 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4336  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.5 
 
 		 203 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>