79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8195 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  57.03 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  54.14 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  54.89 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  54.89 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  54.14 
 
 
133 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  55.81 
 
 
143 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  57.36 
 
 
141 aa  139  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  57.72 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  55.04 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  56.2 
 
 
133 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  54.1 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  53.33 
 
 
129 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  47.93 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  43.41 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  35.04 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  35.58 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  37.37 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  37.37 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  37.37 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  30.08 
 
 
326 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  33.98 
 
 
337 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  31.43 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  32.81 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  30.77 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  30.91 
 
 
335 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  28.95 
 
 
141 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  29.47 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  31.97 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  27.91 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  29.51 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  27.91 
 
 
149 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  31.13 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  34.48 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  34.48 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  34.48 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  32.26 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  31.9 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  30.09 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.86 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30.51 
 
 
151 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  26.27 
 
 
138 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  30.83 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  26.85 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  29.17 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  26.27 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  34.18 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  29.76 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  26.27 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  28.42 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  31.15 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  32.93 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  30.34 
 
 
343 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  27.52 
 
 
339 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  27.84 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.47 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  30 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  26.8 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  32.26 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.11 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  29.27 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.5 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  29.91 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  27.62 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.69 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  27.62 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  27.62 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.69 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.13 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.5 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  31.68 
 
 
127 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  29.36 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  28.3 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  27.66 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  25.84 
 
 
343 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>