28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7195 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  56.34 
 
 
352 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  39.47 
 
 
375 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  39.47 
 
 
407 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  36.31 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  35.86 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  36.31 
 
 
366 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  34.67 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  35.16 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  30.46 
 
 
328 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  33.03 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  34.57 
 
 
690 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  27.99 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  38.84 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  30.38 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  37.19 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  37.19 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  26.99 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  34.91 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  32.2 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  32.52 
 
 
255 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  30.74 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  27.84 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  27.35 
 
 
371 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  31.89 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  31.97 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  36.94 
 
 
362 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  34.67 
 
 
422 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>