43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2796 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  47.1 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  43.16 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  34.13 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  30.56 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  32.4 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  32.66 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  35.25 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  31.97 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.35 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  30.8 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  30.16 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  28.22 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  29.95 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  28.73 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.31 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.89 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  30.12 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  26.45 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  37.84 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.09 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  28.28 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  34.4 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.24 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  23.47 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  23.37 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  31.08 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.92 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.55 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>