64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2746 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  67.11 
 
 
372 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  65.03 
 
 
389 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  58.85 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  63.64 
 
 
383 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  58.07 
 
 
386 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  62.86 
 
 
383 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  57.88 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  59.28 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  53.02 
 
 
369 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  55.69 
 
 
328 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  34.82 
 
 
443 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  33.95 
 
 
484 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  31.11 
 
 
444 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  33.65 
 
 
471 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  32.31 
 
 
458 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  28.57 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  30.03 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  29.76 
 
 
435 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  34.76 
 
 
499 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  32.35 
 
 
440 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  31.34 
 
 
445 aa  126  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  31.14 
 
 
455 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  31.14 
 
 
587 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  27.57 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 
504 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
494 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  28.98 
 
 
630 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  27.3 
 
 
560 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30.83 
 
 
631 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  36.07 
 
 
587 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  25.21 
 
 
612 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  23.36 
 
 
624 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
633 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.94 
 
 
593 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  21.43 
 
 
593 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  26.54 
 
 
653 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  26.54 
 
 
653 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  26.54 
 
 
653 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  21.43 
 
 
593 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  23.96 
 
 
442 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  26.54 
 
 
653 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  25 
 
 
607 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  25.31 
 
 
653 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  25.31 
 
 
653 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  24.07 
 
 
653 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  25.31 
 
 
653 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  29.01 
 
 
624 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.12 
 
 
638 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  30.6 
 
 
693 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  45.45 
 
 
697 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  31.03 
 
 
739 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
639 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  32.06 
 
 
640 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  25.69 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  31.3 
 
 
628 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  31.3 
 
 
628 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  38.78 
 
 
630 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 
726 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  24.23 
 
 
583 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  41.3 
 
 
625 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  26.52 
 
 
629 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  25.56 
 
 
626 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.07 
 
 
632 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>