42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1438 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  68.75 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  48.56 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  48.33 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  48.33 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  45.24 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.77 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  46.63 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.54 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.01 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  33.99 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.73 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.54 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.86 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.63 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.37 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  26.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  24.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.56 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  23.2 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.5 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 		 234 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.47 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  21.3 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  24.59 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.55 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.45 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 216 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  31.06 
 
 		 261 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  31.06 
 
 		 241 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  24.39 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>