71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1222 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  100 
 
 
63 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  60.66 
 
 
62 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  54.84 
 
 
62 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  53.23 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  53.45 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  47.89 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  52.46 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  46.55 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  46.55 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  46.55 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  52.46 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  49.18 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  46.55 
 
 
551 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  49.21 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  43.55 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  46.67 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  44.26 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  45.16 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  45.9 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  45 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  41.94 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.88 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.31 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  46.03 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  46.03 
 
 
63 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  43.28 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  40.91 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  45.9 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  40.32 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  44.64 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  39.34 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  41.18 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  42.19 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  38.71 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  45.16 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  45.16 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  45.16 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  43.75 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  49.18 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  38.1 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  43.55 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  40.91 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  37.29 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  41.27 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  48.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  42.42 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  57.89 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  42.62 
 
 
101 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  43.75 
 
 
66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  40.32 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  44.26 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  50 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  40.62 
 
 
66 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>