More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0753 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0753  ABC transporter, permease  100 
 
 
277 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.22 
 
 
290 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5267  ABC transporter, permease  51.44 
 
 
264 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197747  normal  0.0868677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
288 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
312 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
300 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
299 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
359 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  34.47 
 
 
279 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
299 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
286 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
293 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
293 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
300 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1010  peptide ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
286 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
300 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
867 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
309 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
309 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
298 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.69 
 
 
278 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
310 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
294 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.93 
 
 
321 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  34.67 
 
 
301 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
306 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
298 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
280 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
303 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  35.06 
 
 
295 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
304 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.52 
 
 
282 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
315 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  35.85 
 
 
300 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  36.95 
 
 
270 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
297 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  35.36 
 
 
273 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
301 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
310 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
311 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
301 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
301 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
289 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
295 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
294 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
303 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
293 aa  148  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
286 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
307 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
304 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
299 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  35.52 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  hitchhiker  0.000000145682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.07 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1080  peptide ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0826305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.27 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
309 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
300 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  36.8 
 
 
308 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
290 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.450042  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  34.59 
 
 
284 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
295 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00302437  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
313 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  36.24 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.270364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1972  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000233159  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0564  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  32.59 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.33 
 
 
303 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>