More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2153 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  63.6 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  63.6 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  64.71 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  60.16 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  60 
 
 		 242 aa  288  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  54.63 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  50.61 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  50.4 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  50.4 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  50.4 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  50.4 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  50.4 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  52.77 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  50 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  50 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  51.06 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  51.06 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  51.28 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  51.28 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  51.28 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  47.18 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  43.35 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  39.29 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  38.34 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  33.33 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.51 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  36.4 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 266 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.74 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  29.34 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  35.84 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  32.9 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  34.39 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  32.47 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  34.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  36.32 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  35.92 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  35.5 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  34.04 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  30.38 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  39.91 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  35.78 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  35.56 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  37.22 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  33.89 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.44 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  36.07 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  34.75 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  37.78 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  38.6 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  37.08 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  32.91 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.91 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  32.91 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  35.1 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  37.56 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  35.93 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  32.22 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  36.56 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.77 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  36.4 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  34.71 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.49 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  32.53 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.51 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.34 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  34.05 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.15 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  36.2 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  36.79 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  34 
 
 		 490 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>