41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3122 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  84.06 
 
 
415 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  86.27 
 
 
415 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  92.53 
 
 
417 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  86.02 
 
 
415 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  840    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  90.84 
 
 
417 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  86.27 
 
 
415 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  85.02 
 
 
415 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  87.06 
 
 
425 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  86.02 
 
 
415 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  77.29 
 
 
412 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  84.54 
 
 
415 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  84.54 
 
 
415 aa  700    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  84.78 
 
 
415 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  84.78 
 
 
415 aa  699    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  82.89 
 
 
415 aa  684    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  63.83 
 
 
420 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  60.14 
 
 
448 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  55.53 
 
 
419 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  56.75 
 
 
422 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  49.52 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  48.35 
 
 
410 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  49.64 
 
 
414 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  49.52 
 
 
416 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  44.8 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  43.56 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  43.32 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  46.02 
 
 
415 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  48.69 
 
 
397 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  36.36 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  37.3 
 
 
387 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  34.96 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  35.05 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  28.86 
 
 
387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  29.02 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  28.42 
 
 
388 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  28.29 
 
 
376 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  24.93 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.97 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  24.37 
 
 
371 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  25.35 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>