More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6287 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6287  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  56.41 
 
 
229 aa  205  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1074  ABC transporter related  50.54 
 
 
252 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.281919  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.64 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  43.96 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2859  ABC transporter related  45.54 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4726  ABC transporter related  49.21 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4812  ABC transporter related  49.21 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5111  ABC transporter related  49.21 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.48212  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5326  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 
218 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  41.24 
 
 
263 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42 
 
 
262 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  38.58 
 
 
256 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  38.94 
 
 
278 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  39.33 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07790  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.44 
 
 
272 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  41.67 
 
 
298 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  41.62 
 
 
259 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  42.71 
 
 
300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.95 
 
 
490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
254 aa  133  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  40.1 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  41.75 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
247 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.62 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 
249 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  39.29 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  39.62 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.43 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
256 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
256 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  41 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  41 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.9 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  43.56 
 
 
280 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  34.98 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  42.27 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  41.67 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  34.98 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  41.67 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  34.55 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  35.48 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  39.7 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  41.67 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
249 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  37.44 
 
 
248 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  35.34 
 
 
257 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  34.16 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  39.11 
 
 
288 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  37.43 
 
 
263 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.26 
 
 
262 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
249 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
249 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
255 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  40.37 
 
 
283 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  40.7 
 
 
271 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  41.12 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  40.21 
 
 
288 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  40.37 
 
 
283 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
249 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  39.38 
 
 
274 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  36.95 
 
 
258 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  37.02 
 
 
262 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  33.5 
 
 
256 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  36.65 
 
 
248 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.74 
 
 
255 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  38.34 
 
 
268 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  40 
 
 
283 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
254 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
254 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  38.54 
 
 
252 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  41.15 
 
 
268 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
247 aa  121  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  31.92 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  39.63 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.81 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  32.52 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  32.38 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  35.08 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>