More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6280 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  64.06 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 
298 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  65.93 
 
 
297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  53.31 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.71 
 
 
277 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
280 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
280 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.09 
 
 
279 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  50.55 
 
 
273 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  51.09 
 
 
283 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
297 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.1 
 
 
298 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
297 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
272 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
261 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
298 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  48.33 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
275 aa  215  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
303 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
268 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
302 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 
306 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
276 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
306 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
297 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  39.78 
 
 
292 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40 
 
 
299 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.5 
 
 
278 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  38.52 
 
 
297 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  34.67 
 
 
277 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
294 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.19 
 
 
278 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
270 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
282 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
270 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  41.33 
 
 
295 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
290 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
277 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.82 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
274 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
284 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
279 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
269 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  36.02 
 
 
286 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
295 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  35.94 
 
 
278 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  33.9 
 
 
306 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 
278 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
310 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
294 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
274 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
283 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
271 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
246 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
271 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
281 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.04 
 
 
302 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
271 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
295 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
293 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
311 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
279 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  33.58 
 
 
294 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.17 
 
 
279 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  34.77 
 
 
276 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
275 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
283 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 
281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
276 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  34.69 
 
 
272 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  35.23 
 
 
273 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
272 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  33.21 
 
 
293 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
275 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
319 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.74 
 
 
295 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
301 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
275 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
274 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
300 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
281 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>