More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5390 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 
465 aa  932    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  64.09 
 
 
460 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  62.55 
 
 
466 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.44 
 
 
478 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  55.74 
 
 
475 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  54.06 
 
 
459 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  53.49 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.17 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  53.12 
 
 
464 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  52.02 
 
 
469 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  51.59 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  51.59 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  51.59 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  52.15 
 
 
469 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.39 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.48 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  49.17 
 
 
487 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  45.45 
 
 
468 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  45.49 
 
 
467 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.95 
 
 
462 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.34 
 
 
484 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 
487 aa  263  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.98 
 
 
536 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
457 aa  253  6e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.46 
 
 
488 aa  246  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.01 
 
 
528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 
469 aa  244  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 
475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
476 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
459 aa  229  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  29.83 
 
 
460 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 
459 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.69 
 
 
456 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.26 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 
467 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  32.91 
 
 
466 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.53 
 
 
546 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  35.78 
 
 
468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.68 
 
 
550 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  33.33 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  31.28 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.21 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  28.6 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  30.73 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  31.77 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  32 
 
 
467 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.5 
 
 
468 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 
467 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  29.72 
 
 
464 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
467 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  33.71 
 
 
467 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  30.41 
 
 
459 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.61 
 
 
455 aa  211  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  30.41 
 
 
459 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  30.43 
 
 
458 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  29.49 
 
 
464 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  31.77 
 
 
590 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  31.77 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  30.62 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.75 
 
 
459 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  31.77 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  30.47 
 
 
458 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  31.28 
 
 
459 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.71 
 
 
546 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
467 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  31.28 
 
 
459 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 
463 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  32.27 
 
 
466 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.2 
 
 
468 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.56 
 
 
459 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  33.26 
 
 
503 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.71 
 
 
546 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  29.76 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.57 
 
 
467 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.16 
 
 
467 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 
463 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  35.53 
 
 
548 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
467 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
480 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
467 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  33.26 
 
 
720 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
460 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.88 
 
 
471 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  33.67 
 
 
468 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 
463 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.62 
 
 
468 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  31 
 
 
602 aa  203  5e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.36 
 
 
474 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.69 
 
 
478 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.16 
 
 
581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  31.34 
 
 
459 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31.47 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.79 
 
 
482 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  30.11 
 
 
459 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.47 
 
 
478 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>