43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4436 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
396 aa  784    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  69.62 
 
 
392 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  69.11 
 
 
392 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.46 
 
 
395 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.2 
 
 
399 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  57.83 
 
 
399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.16 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  57.22 
 
 
403 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  61.79 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  59.47 
 
 
404 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.84 
 
 
395 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.86 
 
 
407 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  59.61 
 
 
407 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.7 
 
 
398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  57.37 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  58.18 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.18 
 
 
415 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.7 
 
 
373 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  55.82 
 
 
373 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.29 
 
 
373 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.22 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.46 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  48.68 
 
 
394 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  48.68 
 
 
394 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  51.85 
 
 
365 aa  348  9e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  53.68 
 
 
399 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  47.35 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  47.35 
 
 
394 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  47.35 
 
 
394 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  52.96 
 
 
394 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  46.54 
 
 
393 aa  330  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  48.59 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  50.56 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.39 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.91 
 
 
372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.88 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.49 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  50.33 
 
 
354 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  62.76 
 
 
239 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  41.48 
 
 
394 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  52.94 
 
 
156 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  31.18 
 
 
407 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  27.56 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>