More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4260 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  323  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  49.67 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  48.3 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  44.81 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  49.33 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  49.67 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  50.97 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  49.66 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  49.25 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  42 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  46.36 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 412 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  45.95 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  45.95 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  45.95 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.19 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  51.82 
 
 		 432 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  43.06 
 
 		 414 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.84 
 
 		 412 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.23 
 
 		 420 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 423 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  44.68 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  46.58 
 
 		 203 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 416 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  48.48 
 
 		 427 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  47.06 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  42.86 
 
 		 418 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.04 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  47.73 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.18 
 
 		 413 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  42.26 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.91 
 
 		 417 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  52.9 
 
 		 408 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  52.9 
 
 		 408 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  43.79 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  46.67 
 
 		 418 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  47.55 
 
 		 436 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.54 
 
 		 218 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  44.59 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  43.18 
 
 		 411 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  41.5 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  42.57 
 
 		 433 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  44.08 
 
 		 182 aa  97.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  46.85 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  42.47 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  42.47 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  40.13 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  42.76 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  44.59 
 
 		 196 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  42.76 
 
 		 419 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  43.71 
 
 		 438 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 413 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  46.94 
 
 		 420 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  41.35 
 
 		 425 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  40 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  47.93 
 
 		 420 aa  95.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  45.79 
 
 		 420 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  44.37 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50.79 
 
 		 410 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 437 aa  94.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  43.84 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  50.72 
 
 		 408 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  42.42 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 		 415 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.62 
 
 		 424 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  40.85 
 
 		 419 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 413 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  48.72 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 		 432 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 414 aa  92.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  41.98 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 		 414 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  41.83 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  43.23 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  36.81 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.97 
 
 		 415 aa  91.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  35.66 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  41.67 
 
 		 415 aa  91.3  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 		 414 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  40.88 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  44.22 
 
 		 413 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  42.86 
 
 		 434 aa  90.9  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  40.37 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  44.12 
 
 		 421 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  39.73 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  37.58 
 
 		 416 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  39.73 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  39.73 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  43.97 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>