More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3666 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3666  ABC transporter related protein  100 
 
 
241 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0256  ABC transporter related  53.18 
 
 
239 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1292  ABC transporter related  48.88 
 
 
242 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325638  normal  0.33729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
318 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  34.58 
 
 
309 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  38.1 
 
 
292 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
309 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
309 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
309 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  37.89 
 
 
260 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.81 
 
 
741 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  40.87 
 
 
295 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.13 
 
 
303 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
309 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 
318 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
305 aa  142  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
309 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.72 
 
 
307 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
273 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.29 
 
 
293 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
309 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  41.21 
 
 
304 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  40.29 
 
 
308 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  41.62 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.79 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  40.61 
 
 
406 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.39 
 
 
913 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  40.82 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.27 
 
 
244 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  37.05 
 
 
244 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  37.05 
 
 
244 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  37.05 
 
 
244 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.76 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  39.07 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.75 
 
 
299 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  36.16 
 
 
244 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
308 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  38.42 
 
 
310 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.15 
 
 
303 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.05 
 
 
244 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  36.16 
 
 
244 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  38.92 
 
 
292 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  36.16 
 
 
244 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  33.75 
 
 
251 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  36.16 
 
 
244 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.76 
 
 
243 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  40.26 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  32.88 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.71 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
230 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 
244 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.84 
 
 
305 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  38.25 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  33.64 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  41.62 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.71 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.68 
 
 
307 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  35.71 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  42.5 
 
 
911 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.74 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.38 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  38.71 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.06 
 
 
326 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  40.53 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2783  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.28 
 
 
304 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  37.33 
 
 
942 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.7 
 
 
339 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  38.81 
 
 
302 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.62 
 
 
310 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.5 
 
 
316 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  38.12 
 
 
326 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  32.66 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  32.66 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  36.04 
 
 
932 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 
345 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  32.42 
 
 
307 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39 
 
 
291 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  38.38 
 
 
912 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  36.56 
 
 
909 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  35.94 
 
 
301 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.35 
 
 
322 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  32.86 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.14 
 
 
326 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.65 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.38 
 
 
316 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  39.09 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  39.09 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.5 
 
 
915 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.51 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>