More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2543 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 483 aa  936    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.98 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.31 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.41 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.3 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.43 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.64 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.94 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.38 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  49.39 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  50.1 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.84 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.12 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.46 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  48.54 
 
 		 487 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.36 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.56 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.08 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.42 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  46.99 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.93 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.47 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.14 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.17 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  45.47 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  47.5 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  50.74 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.94 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.53 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.06 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.94 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.94 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.94 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.09 
 
 		 470 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.69 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.07 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.83 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.7 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.7 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  40.48 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.83 
 
 		 438 aa  282  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.61 
 
 		 440 aa  275  9e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.67 
 
 		 444 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.14 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.96 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.14 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.14 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  37.94 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  37.72 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.17 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.29 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.21 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.93 
 
 		 460 aa  256  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.94 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.42 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  37.28 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.28 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  34.75 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  35.13 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  36.84 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  36.12 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.51 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.45 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.04 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.45 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.01 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.54 
 
 		 441 aa  246  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.35 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.18 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.48 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.7 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  36.07 
 
 		 428 aa  243  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.04 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.64 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.42 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.62 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.05 
 
 		 466 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  37.44 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.6 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.39 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.75 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.6 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.13 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.76 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.86 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.49 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.68 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.91 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  36.38 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  34.7 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.04 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.04 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.04 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>