More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3796 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  77.14 
 
 		 430 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  76.57 
 
 		 430 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  77.14 
 
 		 430 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  78.75 
 
 		 430 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 454 aa  885    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.73 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.73 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.02 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.27 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  64.35 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.04 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.73 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.27 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.39 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.34 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  63.81 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  64.34 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.27 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.87 
 
 		 433 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  64.5 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  64.04 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.17 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.75 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  63.81 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.17 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  62.94 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.7 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  62.01 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.7 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.7 
 
 		 433 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.36 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.7 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.7 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  61.54 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  61.54 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  61.31 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.72 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.66 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  61.54 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.31 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.23 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.09 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.38 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.14 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  58.12 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.9 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  56.38 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  55.45 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  56.54 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.67 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.51 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.21 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.75 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  54.65 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.66 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.38 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  53.45 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.26 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  53.01 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.49 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.45 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.02 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.79 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.16 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  52.79 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  51.4 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.4 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 		 429 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.41 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  52.18 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  52.41 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.92 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  50 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  50 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.61 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  50 
 
 		 445 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  50 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.17 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.77 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.32 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.4 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  50.46 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  50.23 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.07 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.52 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.46 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  50.46 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.84 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>