More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2004 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 465 aa  916    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  98.92 
 
 		 465 aa  906    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B21  putative guanine/xanthine permease  55.25 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B22  putative guanine/xanthine permease  55.45 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.89 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.82 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.42 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.52 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  48.99 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  48.54 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  45.45 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.61 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.57 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.17 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.32 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.87 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  44.99 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.38 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  45.91 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.29 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.7 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.19 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.78 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.77 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.97 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.65 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.74 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.09 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.46 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.1 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.32 
 
 		 431 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.55 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  48.22 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  43.64 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.44 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.65 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.09 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.65 
 
 		 449 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.09 
 
 		 431 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.65 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.39 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.4 
 
 		 471 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.74 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.74 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.76 
 
 		 449 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  43.96 
 
 		 429 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.87 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  44.42 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 449 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.34 
 
 		 429 aa  348  9e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.63 
 
 		 429 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.82 
 
 		 434 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  42.63 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.5 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.71 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  45.23 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  41.7 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  41.93 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.4 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.62 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  42.4 
 
 		 433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.34 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.8 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.58 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.58 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  40.71 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.86 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  43.21 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.54 
 
 		 430 aa  334  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.89 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.8 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.77 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.77 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.77 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.77 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.8 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  43.08 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.19 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  44.34 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.42 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.52 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.78 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>